В 2002 году Институт проблем управления им. В. А. Трапезникова РАН учредил научно-технический журнал «Проблемы управления». Инициатива создания нового журнала принадлежала директору Института И. В. Прангишвили, который стал его главным редактором, и его заместителю А. Н. Шубину. Журнал начал выходить в свет в 2003 году, сначала четыре выпуска в год, а с 2005 года — шесть. Наряду с традиционными разделами теории и практики управления в журнале значительное внимание уделяется управлению в социально-экономических и организационных системах, управлению развитием крупномасштабных систем, обработке больших массивов информации в иерархических системах, проблемам решения управленческих задач в слабоструктурированных системах и плохо формализуемых ситуациях, АСУ в непромышленной сфере и др., обращается внимание на возможности практического применения излагаемых научных результатов. Редакция стремится к обеспечению комплексности тематики журнала, равномерности охвата проблем современной теории управления, а также такой подаче материалов, чтобы статья имела «дружественный интерфейс к читателю», т.е. чтобы её содержание было понятно не только автору и его ближайшим сотрудникам, но и читателям, работающим в данном или смежном направлении теории управления и её приложений. В число авторов журнала входят как известные, так и начинающие учёные и аспиранты. В ряде городов России при крупных научных и образовательных центрах созданы и работают региональные редсоветы журнала.